中國科學家成功破譯南美白對蝦基因組

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中國科學院海洋研究所科研團隊歷時10年成功破譯凡納濱對蝦(又稱“南美白對蝦”)基因組,並獲得高質量的對蝦基因組參考圖譜,研究成果在《自然》雜誌子刊《自然通訊》在線發表。

  中國科學院海洋研究所研究員相建海介紹,對蝦基因組是世界上公認的高複雜基因組,中國科學院海洋研究所科研團隊嘗試了從一代到三代的各種基因組測序平台及各種組裝軟件,最終完成了凡納濱對蝦的全基因組測序和組裝,並獲得了高質量的對蝦基因組參考圖譜。

  通過分析發現,凡納濱對蝦共有約24億個鹼基對。以1-6鹼基為單位多次重複的簡單串聯序列(SSR)佔對蝦基因組的23.93%以上,是目前已測基因組物種中含量最高的,這也是對蝦基因組高複雜性的根本原因。

此外,科研人員在對蝦基因組上發現了兩大結構特徵:大量的物種特異性基因和大量的串聯重複基因,這可能與對蝦科的特異性進化有密切聯繫。

中國科學院海洋研究所研究員李富花表示,對蝦基因組的破譯,為甲殼動物底棲適應和蛻皮等研究提供了重要理論基礎和數據支撐,同時也為對蝦基因組育種和分子改良工作提供了重要基礎平台。

 據了解,凡納濱對蝦作為四大養殖蝦類之首,其全球年產量達416萬噸,具有非常重要的經濟價值。凡納濱對蝦產量佔全球的四分之一以上。由於種質資源匱乏,每年需從國外引進大量凡納濱對蝦苗種。

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