政院长赖清德与总统府秘书长陈菊原为九合一大败请辞，经过总统蔡英文恳谈慰留，赖清德、陈菊26日决定留任，维持府院铁三角，稳定选后政局。
九合一选举大败，蔡英文在24日当晚辞去党主席，赖清德与陈菊也分别请辞。虽然蔡英文随即慰留两人，但赖清德认为应该要为选举结果负责，第一时间动向未明。
这2天，也传出陈菊辞意甚坚，请幕僚打包办公室与台北住处，打算返回高雄。
陈菊今年4月才卸下高雄市长，接任总统府秘书长，蔡英文、赖清德和陈菊被形容为执政铁三角，受到九合一败选冲击，赖清德和陈菊双双请辞，为了政局稳定与政策推动，蔡英文前天再和两人恳谈，全力慰留。
赖清德昨天上午亲自召开记者会指出，他前天下午跟蔡英文讨论，最后决定留下来继续努力，希望行政院政务推动不至于中断，也协助稳定政局，后续行政院会负起责任，滚动检讨各项政策，在短期内完成公投相关法案，积极回应人民期待。
赖清德说，将如期到立法院报告普悠玛事件；其他包括108年度中央政府总预算、前瞻基础建设第二期预算、加入CPTPP相关法制作业，都在立法院审议中，他也有责任持续推动，让法案通过，这也是他决定留下来的原因。
赖清德开完记者会后不久，总统府也对外宣布，蔡英文考量国家政局稳定与各项重大政策的持续推动，潜晚邀集陈菊恳谈，再三慰留，陈菊决定留任，全力襄助总统在扩大社会对话以及各项革新工作上的努力。
总统府表示，蔡英文认为，就在这个国家革新前进的关键期间，执政团队的切实检讨与稳健推进非常重要，她希望陈菊能够继续与团队并肩作战，协助她带领执政团队在最短时间内凝聚最大的革新锐意，把各项工作做到最好，以回应国民的期待。
立法院长苏嘉全表示，一场选举选输不是单一事项，是非常多因素累积而成，如果大家都认为是自己的因素就辞职，「我看大概每个人都要辞职」，他认为现阶段还是以政局稳定为重，朝对的方向做，相信民进党还是会得到民心。
蔡英文辞去民进党主席一职后，民进党党务系统将改组，目前党内已经有人喊出「中生代提早全面接班」，党内多位要角也被点名接任党主席。
