因应中央疫情指挥中心宣布全国第三级警戒延长至6月28日，民航局已协调航空公司免手续费退票延长到28日，也呼吁端午连续假期尽量避免外出，如仍有搭机必要的旅客，可于设快筛站之6机场自愿筛检，避免疫情传播。
民航局表示，已协调国内线航空公司，第三级警戒期间，即至6月28日24时止之国内线航班，可免手续费退票，申请期间及相关作业细节，旅客可洽航空公司询问或至其官网查询。
配合中央疫情指挥中心防疫政策，降低民众染疫风险，针对即将到来的端午节连续假期，民航局也呼吁，最佳的过节方式就是待在家里，避免跨区移动及非必要外出，透过视讯、电话和远方亲友报平安，表达关心，共同努力尽早恢复正常生活。
依据中央疫情指挥中心核定及协助台东县政府，民航局已配合于台北、台中、高雄、嘉义、台南及台东等6个有飞往离外岛航班之航空站设置筛检站，提醒欲前往澎湖、金门、马祖及兰屿、绿岛之搭机旅客应提早至少90分钟到机场办理填写、缴交健康声明书，有症状者需接受核酸检测、不得登机，如果旅客搭机前14天内有疑似症状者需接受快筛，采检阴性才允许登机；另旅客亦可自愿进行快筛，于采检阴性后登机，以共同防止疫情传播到离外岛地区，以维护自身及家人暨离岛乡亲的健康。
