高雄市長韓國瑜日前主張重推自由經濟示範區，國民黨立法院黨團隨即火速提出自由經濟特區特別條例草案並完成連署。蔡政府官方卻表態不支持，財政部長蘇建榮11日答詢表示，自貿區的區內區外課稅不同會形成租稅不公平，也可能讓台灣像韓國、泰國一樣遭列租稅不合作名單，另外，美中貿易爭端之下，若藉由自貿區進行轉口貿易，也會影響台灣。農委會主委陳吉仲受訪時更認為會傷害台灣農業。
自由經濟示範區是馬政府2012年提出，由於朝野意見分歧，草案長期被冷凍在立法院；雖然2015年立法院委員會表決通過，逕付二讀，但2016年政黨輪替後不了了之。國民黨黨團已草擬自由經濟特區條例草案並完成連署，將加速推動，
農委會陳吉仲表示，自由經濟示範區會嚴重傷害台南、高雄、屏東的農業，最後結果可能會跟韓市長講的‘貨出去、人進來’剛好顛倒。
立法院經濟委員會昨天審查2019年度中央政府總預算案附屬單位預算非營業部分包括，農業作業基金、農業特別收入基金，邀請農委會主委陳吉仲列席。
陳吉仲指出，因為所有自由經濟示範區，原料進來都是免稅，他要問，所有食品加工業者會用國外的還是國內的原料，更何況用的材料如果是國外農產品，出口後卻是掛MIT（台灣製造），這部份可能要慎思。
