水库清淤工程十分困难，政府近年加速推动。水利署表示去（109）年清淤量为历史最高，为历年平均值（564万立方公尺）的2.6倍。另外针对全台13座重要供水及淤积高风险之水库，包括石门、明德、雾社、德基、日月潭、仁义潭、曾文、白河、乌山头、南化、阿公店、澄清湖及牡丹水库，经济部105年拟定政策「水库库容有效维持纲要计画」，透过上游集水保育减淤、库区加强清淤排淤等措施，并推动各项水库改造计画如防淤隧道及绕库排砂隧道等，以达成120年以前泥砂进出平衡为目标。截至109年底已达成石门、明德、仁义潭、白河、曾文、乌山头、阿公店、澄清湖及牡丹水库等9座淤积零成长；预计111年底达成日月潭及南化水库等2座水库；120年底达成德基及雾社水库等2座水库淤积零成长。
水利署强调，蔡总统及苏院长皆非常重视水利建设，自去年7月即督促经济部提前部署，除旱灾中央灾害应变中心自去年10月成立，蔡总统2月视察新竹紧急海淡、苏院长则于去年8、10月视察曾文、石门水库，今年3月至苗栗竹南关注水情，并推动紧急抗旱水源利用计画。
水利署指出，前瞻水环境建设项下水与发展各项计画已陆续完成并发挥成效，如桃园支援新竹干管工程于110年2月1日供水，桃园支援新竹水量由每日7万吨提升至20万吨。伏流水开发计画于109年完成高雄溪埔伏流水，可增加备援水量每日15万吨，防灾备援水井自106年7月起运用前瞻计画整备建造160口水井，纳入自来水系统每日增供34万吨，受益于前述建设及超前部署应变，今年前所未有的大旱，才能延长新竹宝山-宝二水库、苗栗永和山水库及台中鲤鱼潭等水库供水时程。
